病原检测时，应选择临床症状典型、能代表整个群体发病特点的病畜进行剖解，最好选择发病早期的病畜，数量一般3～5头为宜；
剖解后采取病变典型组织送检，一般以肺脏、脾脏、淋巴结、扁桃体、血样等为主；
作细菌性疾病检测，应尽量做无菌剖检和无菌采样，送检前5～7天内待检猪只应避免各种途径使用抗生素类药物。
【血液样品采集】
血清学监测时，应区分猪群种类、胎次/阶段，根据免疫情况和检测项目采集合适群体的样本；
尽量在采食之前或进食2小时后采集，避免在一天最热的时间段；
相同/相近的群体进行随机采样，采样比例为：5～10%左右，一般不低于10个样本；
前腔静脉采集血液2～5mL，37℃（或25℃以上室温）倾斜静置60分钟以上，充分凝血并析出血清后2～8℃冷藏保存。
【样品保存与运输】
样品采集后，在条件允许的情况下，最好尽快直接送到实验室；
组织样品一般采用冷冻运输（细菌分离除外），最好在冰箱冷冻后再运输；
血液样品应置于2～8℃低温环境中冷藏保存，避免血液与冰块直接接触，防止冻结溶血，严禁血液采集后直接加冰块运输；
样品运输方法：放入泡沫保温箱中运输，视气温情况和运输时间长短加入足够冰袋，最好在24小时内送至实验室，越快越好，一般不能超过48小时。
【注意事项】
凡怀疑重大烈性传染病，如口蹄疫、禽流感、炭疽等不宜解剖的患畜，严禁剖检；
采取病料的种类，根据不同的疫病或检验目的，采其相应的血样、活体组织、脏器、肠内容物、分泌物、排泄物或其它材料；
内脏病料的采取，建议剖检活体；如患畜已死亡3小时以上，不予采取病料；
采样时作好人身防护，必须戴手套，必要时戴口罩，严防人畜共患病感染；
详细登记样品信息（样品名称、数量、群体、日龄、时间、场房等）和养殖场背景信息（如养殖场名称、地址、送检人、联系方式、背景信息--最近免疫时间、免疫程序、畜群疫病及采取的措施等），将登记资料与样品一同送至实验室。